Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,159,910 C→T D837D (GAC→GAT mdtB → multidrug efflux system, subunit B

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,159,9100CT100.0% 239.0 / NA 64D837D (GAC→GATmdtBmultidrug efflux system, subunit B
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/64);  total (0/64)

TAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGG  >  W3110S.gb/2159871‑2159935
                                       |                         
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               cGATGCGGTGCAGGCGATTATGGATACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCgg  <  1:1087180/50‑1 (MQ=255)
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TAACTATTCGCTGGGCGATGCGGTGCAGGCGATTATGGACACCGAAAAGACGCTGAATCTGCCGG  >  W3110S.gb/2159871‑2159935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: