Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	155,463	A→T	*247K (TAA→AAA)	ecpD ←	predicted periplasmic pilin chaperone

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	155,463	0	A	T	100.0%	191.3 / NA	51	*247K (TAA→AAA)	ecpD	predicted periplasmic pilin chaperone
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (20/31);  total (20/31)

TAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTACAGCCTGGCATTACCTTCAATTGC  >  W3110S.gb/155408‑155487                                                        |                         tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:582974/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1712813/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:172553/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1751098/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1784170/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1813906/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1821268/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:369896/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:575816/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1801544/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:647844/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:71653/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:729273/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:775206/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:930399/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:962843/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:987880/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:999674/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1077271/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1403550/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1513494/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1334356/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1296039/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1273256/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1581180/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1127890/64‑1 (MQ=255) tAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGACTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1885899/64‑1 (MQ=255)  aGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:685451/63‑1 (MQ=255)  aGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:471043/63‑1 (MQ=255)               gTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1599607/50‑1 (MQ=255)                tCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTgg                  <  1:1355140/49‑1 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:887445/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1216697/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1205062/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:964211/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:683058/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1335882/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:499182/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:56385/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:55527/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1622337/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:272229/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:258314/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:234553/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1571528/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:100784/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1588067/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1604938/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1605972/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1671899/1‑64 (MQ=255)                 cACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTTCAGCCTGGCATTACCTTCAATTgc  >  1:1645246/1‑64 (MQ=255)                                                        |                         TAGTATATTCTATAGTCACGCTATGCTTCCTGCGGAATTATATCCTTGCCTGATTACAGCCTGGCATTACCTTCAATTGC  >  W3110S.gb/155408‑155487

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑