Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,551,876 T→C F220L (TTC→CTC)  yfeU → predicted PTS component

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,551,8760TC100.0% 142.1 / NA 38F220L (TTC→CTC) yfeUpredicted PTS component
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (38/0);  total (38/0)

CTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGTTCGGCAACCTGATGGTCGA  >  W3110S.gb/2551831‑2551895
                                             |                   
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCATCCTGATGGTCGa  >  1:808230/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATgg      >  1:639344/1‑61 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCg   >  1:1702862/1‑64 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:593699/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1861561/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:236054/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:244682/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:395889/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:43607/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:440178/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:476305/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:559031/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1834452/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:66654/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:752851/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:815590/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:818684/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:823918/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:984478/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:998563/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1477630/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1102665/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1220333/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:13046/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1336174/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1357655/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1381989/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1437279/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1070630/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:148682/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1488034/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1570871/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1628358/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1657407/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1696599/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1800041/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1815147/1‑65 (MQ=255)
cTCAATATGCTTTCCACCGGCCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1286149/1‑65 (MQ=39)
                                             |                   
CTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGTTCGGCAACCTGATGGTCGA  >  W3110S.gb/2551831‑2551895

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: