Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,551,876	T→C	F220L (TTC→CTC)	yfeU →	predicted PTS component

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,551,876	0	T	C	100.0%	142.1 / NA	38	F220L (TTC→CTC)	yfeU	predicted PTS component
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (38/0);  total (38/0)

CTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGTTCGGCAACCTGATGGTCGA  >  W3110S.gb/2551831‑2551895                                              |                    cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCATCCTGATGGTCGa  >  1:808230/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATgg      >  1:639344/1‑61 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCg   >  1:1702862/1‑64 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:593699/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1861561/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:236054/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:244682/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:395889/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:43607/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:440178/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:476305/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:559031/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1834452/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:66654/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:752851/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:815590/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:818684/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:823918/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:984478/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:998563/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1477630/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1102665/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1220333/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:13046/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1336174/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1357655/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1381989/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1437279/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1070630/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:148682/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1488034/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1570871/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1628358/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1657407/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1696599/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1800041/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1815147/1‑65 (MQ=255) cTCAATATGCTTTCCACCGGCCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGCTCGGCAACCTGATGGTCGa  >  1:1286149/1‑65 (MQ=39)                                              |                    CTCAATATGCTTTCCACCGGGCTGATGATTAAATCCGGCAAAGTGTTCGGCAACCTGATGGTCGA  >  W3110S.gb/2551831‑2551895

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑