Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,788,749 C→T P38S (CCG→TCG)  ygaF → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,788,7490CT100.0% 429.1 / NA 112P38S (CCG→TCG) ygaFhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (112/0);  total (112/0)

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

TGCTGGAAAAAGAGTCCGCCCCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGCC  >  W3110S.gb/2788729‑2788793
                    |                                            
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCca                        >  1:326370/1‑43 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATga   >  1:86659/1‑63 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:365574/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:517726/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:516083/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:510826/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:462584/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:460664/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:459923/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:44775/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:446410/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:408189/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:404203/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:396251/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:532265/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:335065/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:325245/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:307018/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:306514/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:304657/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:293972/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1023346/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:252200/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:247054/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:752309/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:955701/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:895874/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:829604/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:816824/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:809555/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:774585/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:528829/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:750209/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:737436/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:71005/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:695386/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:665957/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:654222/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:642310/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:571348/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:547915/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:285650/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1330445/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1514986/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:236193/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1483079/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1473791/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1379901/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1501118/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1302132/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1291599/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1229913/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1156915/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:110331/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1078352/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1074460/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1063824/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1055410/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:10272/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1602924/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1558657/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1543279/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:1525535/1‑65 (MQ=255)
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tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGc   >  1:846382/1‑64 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGc   >  1:1782602/1‑64 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAAAAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:612559/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCCGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCAACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:786385/1‑65 (MQ=255)
tGCTGGAAAAAGAGTCAGCCTCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGcc  >  1:694014/1‑65 (MQ=255)
                    |                                            
TGCTGGAAAAAGAGTCCGCCCCGGCCTGTCACCAGACGGGCCACAACAGCGGCGTGATCCATGCC  >  W3110S.gb/2788729‑2788793

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑