Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4165064	4165066	3	52 [0]	[0] 64	yheN	predicted intracellular sulfur oxidation protein

ACCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCT  >  W3110S.gb/4165004‑4165063                                                            | aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAATCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:596221/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:52650/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:257185/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:2833/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:289585/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:329677/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:416541/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:432296/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:452849/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:487496/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:491683/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:49491/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:509676/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:518276/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:253977/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:543541/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:616309/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:665668/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:748403/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:771599/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:773529/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:791204/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:803010/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:858313/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:935237/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:941875/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1374659/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1048621/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1084541/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:109103/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1126830/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1137720/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1140614/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1175307/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:120562/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1206859/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:120761/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1255764/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1271323/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1020272/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:144262/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1478376/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1508688/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1540126/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1566134/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1575653/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1578242/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1586619/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:1593236/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:165254/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:189954/1‑60 (MQ=255) aCCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCt  >  1:22722/1‑60 (MQ=255)                                                            | ACCTTCAGCAGGGATTTACCTTAAGCGGACTTGGGGCGCTGGCGGAAGCCTCGCTGACCT  >  W3110S.gb/4165004‑4165063

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑