Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4179175	4179323	149	60 [0]	[0] 30	gspG	pseudopilin, cryptic, general secretion pathway

TGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAT  >  W3110S.gb/4179125‑4179174                                                  | tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAATGAt  <  1:583870/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:72618/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1047393/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:453090/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:477612/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:484289/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:502208/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:527102/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:562185/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:571431/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:582574/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:604959/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:6342/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:656748/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:685267/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:42335/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:741499/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:754940/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:756739/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:7979/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:805951/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:868286/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:8829/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:899446/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:918928/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:944966/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:968903/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:979499/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:991697/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1587189/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1049708/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1098552/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1128060/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:114474/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1151159/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:130456/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1324741/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1403087/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1459412/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:147249/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1581729/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:374698/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1596034/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:210383/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:363097/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:357057/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:324810/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:309385/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:298646/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:293412/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:287108/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:282721/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:246404/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:236482/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:235500/50‑1 (MQ=255) tGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:173310/50‑1 (MQ=255)  tgtataGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:752487/47‑1 (MQ=255)  gTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:861776/49‑1 (MQ=255)  gTTATAGTTTGCGGACAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1151653/49‑1 (MQ=255)      taGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAt  <  1:1136958/45‑1 (MQ=255)                                                  | TGTTATAGTTTGCGGCCAGCGGTGGCAGTGTCGGCGCTTCTACTAAGGAT  >  W3110S.gb/4179125‑4179174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑