Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4179675 4179690 16 165 [0] [0] 39 gspF general secretory pathway component, cryptic

Only 100 of 165 total aligned reads displayed.

CACCATGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTG  >  W3110S.gb/4179606‑4179674
                                                                    |
caccaTGTATAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:811094/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:355391/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:557991/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:547007/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:535940/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:527300/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:520157/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:475589/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:451143/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:447381/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:446748/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:388578/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:361034/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:561234/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:348468/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:283101/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:280219/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:272765/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:271417/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:266488/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:206301/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:201672/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:189991/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:169167/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:774742/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:976076/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:965508/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:965380/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:950595/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:893313/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:863736/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:848479/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:846691/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:80512/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:785725/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1034860/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:757817/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:739119/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:732426/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:720305/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:690196/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:684947/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:646268/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:62539/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:594675/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:580594/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1242929/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1373924/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1358982/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1355314/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1347594/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1343241/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1325116/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1294873/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1290527/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:128187/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1272205/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1268470/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1248236/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1594981/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1239157/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1233540/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1223059/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1159329/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1145494/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1083986/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1081134/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1079304/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1057233/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1042341/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1030986/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1452851/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:167843/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1571040/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1568437/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:156355/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1547627/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1538077/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1508082/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1492065/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1456266/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1386137/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1438345/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1386246/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1421661/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:139398/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1396449/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1398693/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTATGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:587847/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGGTTGTTCCAGCGAAAGATGAAAGCTGTTACCCTg  <  1:383791/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCAGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:247141/69‑1 (MQ=255)
caccaTGTAGAGCATCATAGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:324217/69‑1 (MQ=255)
 accaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1180919/68‑1 (MQ=255)
 accaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:408378/68‑1 (MQ=255)
 accaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:887282/68‑1 (MQ=255)
 accaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:382170/68‑1 (MQ=255)
 accaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:1043435/68‑1 (MQ=255)
 accaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:135578/68‑1 (MQ=255)
 accaTGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:497991/68‑1 (MQ=255)
                atcGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTg  <  1:403634/53‑1 (MQ=255)
                                                                    |
CACCATGTAGAGCATCATCGGCGGGAAAATTGCGGTTTGTTCCAGCGAAAGATGAATGCTGTTACCCTG  >  W3110S.gb/4179606‑4179674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑