Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4180671 4181044 374 140 [0] [0] 165 gspE general secretory pathway component, cryptic

Only 100 of 140 total aligned reads displayed.

CAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACT  >  W3110S.gb/4180613‑4180670
                                                         |
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:450853/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:625804/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:623020/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:592167/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:587436/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:582490/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:581610/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:573889/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:555179/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:550276/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:537937/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:4957/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:483103/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:632287/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:445058/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:440647/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:440412/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:426670/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:419753/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:41582/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:406656/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:406397/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:401130/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:399088/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1003156/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:818623/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:986669/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:97083/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:947560/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:923722/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:920235/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:884339/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:869942/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:866976/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:865111/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:84090/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:825698/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:385296/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:808859/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:799321/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:766843/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:763231/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:754084/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:753609/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:742018/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:704118/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:69302/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:687818/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:673349/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1235937/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:136939/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1369278/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1359963/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1350267/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1349852/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1344626/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1343827/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1314313/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1311968/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1278494/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1250577/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1243320/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1429285/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1231967/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1215011/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1176258/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1171363/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1094647/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1072908/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1068849/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1058625/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1025938/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1010033/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1007506/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:24339/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:353815/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:346957/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:345816/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:3420/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:332497/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:319218/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:31050/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:309224/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:296764/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:265996/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:263827/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:362081/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:233798/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:225958/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:198065/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:186579/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1572855/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:1562023/58‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1554249/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1521403/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1505374/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:1478687/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  >  1:146049/1‑58 (MQ=255)
cAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGCGTCACCGCTTATCACt  >  1:597828/1‑58 (MQ=255)
              cGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACt  <  1:874947/44‑1 (MQ=255)
                                                         |
CAGCGTGGCACTGGCGACGCGCATAACCTCATCCCAGGAGGTGTCACCGCTTATCACT  >  W3110S.gb/4180613‑4180670

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑