Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4184559 4184589 31 151 [0] [0] 161 gspC general secretory pathway component, cryptic

Only 100 of 151 total aligned reads displayed.

TCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGCC  >  W3110S.gb/4184490‑4184558
                                                                    |
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACTAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1354023/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTTCAATGcc  >  1:401207/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTCCAATGcc  >  1:954739/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:475703/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:593810/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:585213/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:574181/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:571234/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:565547/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:558851/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:54547/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:543853/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:535450/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:533758/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:518100/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:503111/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:319341/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:472836/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:424608/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:420048/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:389717/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:374455/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:368648/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:344400/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:34418/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:32129/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:309034/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:82771/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:9962/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:993901/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:961070/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:927068/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:920381/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:917132/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:89154/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:877779/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:854882/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:852072/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:829486/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:614999/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:790040/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:787934/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:774604/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:739303/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:717312/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:707757/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:672225/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:670469/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:652714/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:64238/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:616753/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1118783/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1351944/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1341493/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1335916/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1318259/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:131496/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1307782/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:129497/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1256538/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1250084/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1244368/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1241292/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1192740/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1361156/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1112682/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1108594/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1098119/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1090309/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1084702/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1080756/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1078927/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1070977/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1065857/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1065482/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1005344/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1535348/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:303465/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:292901/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:252855/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:250242/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:199933/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:167547/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1604007/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1587239/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1580884/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1570555/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1546437/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1000590/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1516259/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1492282/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:144536/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1442005/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1424720/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1398876/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:137070/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1370472/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1365552/1‑69 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCTCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1516141/1‑68 (MQ=255)
tCGCTTTTGTTCGCACCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGcc  >  1:1476152/1‑69 (MQ=255)
                                                                    |
TCGCTTTTGTTCGCTCCCCTCATTAATTAAGACAAAAGAAGTCTCATCATTCGATGTGAGTACAATGCC  >  W3110S.gb/4184490‑4184558

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: