Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4254591	4254662	72	49 [0]	[0] 214	yjbI	conserved hypothetical protein

ACTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGA  >  W3110S.gb/4254522‑4254590                                                                     | aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:851212/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:413323/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:500672/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:51662/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:522044/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:527712/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:546040/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:571385/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:591921/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:725922/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:726655/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:73421/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:405043/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:864177/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:869225/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:888603/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:888733/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:896579/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:904728/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:939934/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:965257/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:968047/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:970196/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:997229/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1379546/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1021167/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1035105/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1059905/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1120970/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1135033/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1137935/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1149703/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1155537/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1158296/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1158700/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1324194/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1350400/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1000148/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1457040/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:151754/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:153924/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1565452/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:159389/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:1596596/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:184832/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:303456/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:34151/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATAGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:447770/1‑69 (MQ=255) aCTATAAGTGTAAAATTATACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGa  >  1:166972/1‑69 (MQ=255)                                                                     | ACTATAAGTGTAAAATTCTACAGAAATGAAAAAAATTGAATGCGCTTGCAATTTTCTGATGGATAAAGA  >  W3110S.gb/4254522‑4254590

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑