Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4291352	4291430	79	60 [0]	[0] 147	[nrfA]	[nrfA]

TAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGC  >  W3110S.gb/4291283‑4291351                                                                     | tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAACCCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:75569/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:504932/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:221942/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:232010/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1006466/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:264619/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:265913/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:318149/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:371808/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:377046/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:39451/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:403368/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:451429/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:460548/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:477749/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:245661/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:523730/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:577394/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:579817/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:742606/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:760493/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:781308/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:856673/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:876713/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:900698/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:914065/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:946963/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:986286/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1590978/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1060250/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:109552/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1104678/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1130123/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1228081/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1249702/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1261832/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1261935/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1274556/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1316067/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1339834/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1349027/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:138709/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1394440/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1422523/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:143444/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1438952/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:165029/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1401129/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1533125/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1552952/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1574267/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1585891/69‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGGTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:403807/69‑1 (MQ=255) tAGGGGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1443239/69‑1 (MQ=255)  aGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:452819/68‑1 (MQ=255)  aGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:807099/68‑1 (MQ=255)         gTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGTATGAAGc  <  1:887549/61‑1 (MQ=255)            aCTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1469988/58‑1 (MQ=255)                    gAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:1043591/50‑1 (MQ=255)                      aaaaCAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGc  <  1:388209/48‑1 (MQ=255)                                                                     | TAGGTGCGGTTACTGTCGTGAAAAACAATAAAAACCGCCATTGCAACAATGGCGCAATTCGGATGAAGC  >  W3110S.gb/4291283‑4291351

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑