Missing coverage evidence...
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CTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTG  >  W3110S.gb/4295944‑4296012                                                                     | cttgTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:9597/4‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:637502/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1027651/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:365080/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:398307/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:418711/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:512440/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:558681/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:572120/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:573988/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:586665/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:330019/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:686318/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:726222/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:74547/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:789587/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:845716/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:931371/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:963608/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1448939/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1037410/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1050360/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:108570/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1196844/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1259435/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1305205/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1363710/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1402561/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1439504/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:211636/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1457337/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:150731/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:1594669/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:166738/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:175268/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:18415/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTg  >  1:198025/1‑69 (MQ=255) cTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGAACTg  >  1:506386/1‑69 (MQ=255)                                                                     | CTGGTTTCGGTTCATGCGTTCGCGCTGGATAACGTCCGCGCCGTGCCGTTGTTCAGCCTGTTTGCACTG  >  W3110S.gb/4295944‑4296012

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑