Missing coverage evidence...
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CCAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCATT  >  W3110S.gb/4316129‑4316197                                                                     | ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGGACCAtt  <  1:206257/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCttt  <  1:536028/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:630749/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:222933/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:236149/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:256998/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:295905/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:378148/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:538509/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:626144/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:628969/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:982799/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:684335/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:693261/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:768829/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:810197/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:819481/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:834136/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:848741/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:939259/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:980513/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1187403/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1245528/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1287505/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1316593/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1327668/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:133572/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1226028/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:198068/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1412547/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1420562/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1447709/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1488182/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1509043/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1128492/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:152993/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1114998/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:196146/69‑1 (MQ=255) ccAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTCGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1530347/69‑1 (MQ=255)  cAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1408/68‑1 (MQ=255)                       aCAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1442006/47‑1 (MQ=255)                        cAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:256749/46‑1 (MQ=255)                              tGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1378364/40‑1 (MQ=255)                              tGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:224484/40‑1 (MQ=255)                              tGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCAtt  <  1:1086333/40‑1 (MQ=255)                                                                     | CCAGTCGGCAGGCTGGCTGGCGACAAGCTTGATCTGGCTTGCTTTTTTGAAGGCTTCGGTGGCACCATT  >  W3110S.gb/4316129‑4316197

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑