Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4412966	4413051	86	95 [0]	[0] 34	rnr	exoribonuclease R, RNase R

AGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGA  >  W3110S.gb/4412897‑4412965                                                                     | aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCATACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:552255/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGTGCTCGATGa  <  1:251515/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:437070/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:674560/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:674113/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:616892/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:552876/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:548628/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:54672/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:528178/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:449332/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:443303/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:679374/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:423785/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:402043/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:369307/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:322733/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:271972/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:269944/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1553701/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1520796/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:808754/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1033082/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:99611/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:975949/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:960068/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:957226/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:951312/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:933077/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:82373/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:809956/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:998293/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:80278/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:792438/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:786913/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:776016/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:77373/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:757515/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:753464/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:724829/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:720682/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1226710/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1346159/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1335906/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1324980/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1323210/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1310257/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1513600/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1304331/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1290700/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1288768/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1261931/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1305493/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1216399/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1200943/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1177515/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1138445/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1137030/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1111758/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:108348/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1055359/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1052042/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1481285/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1448130/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1346481/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1346826/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1351775/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1424052/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1397561/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1422007/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1376041/69‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAGGCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1178199/69‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1405768/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:759872/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1180827/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1180641/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:840915/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1158015/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1591257/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1550818/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:355758/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1252029/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:712468/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:711277/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:694017/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1371099/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1360900/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:579775/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:450244/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:453089/68‑1 (MQ=255)  gctgctGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:496957/68‑1 (MQ=255)   ctgctgGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1403918/67‑1 (MQ=255)                     gATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:171986/49‑1 (MQ=255)                      aTCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1216400/48‑1 (MQ=255)                        cGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGa  <  1:1288015/46‑1 (MQ=255)                                                                     | AGCTGCTGGAGTCGGTTGCCGATCGTCCTGATGCAGAAATGCTGCAAACCATGCTGCTGCGCTCGATGA  >  W3110S.gb/4412897‑4412965

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑