Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	392252	392256	5	45 [0]	[0] 207	yaiU	hypothetical protein

TAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACG  >  W3110S.gb/392183‑392251                                                                     | tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCATCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:389150/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:664812/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:100221/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:393529/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:405340/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:436224/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:448314/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:543884/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:561025/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:561039/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:636628/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:372717/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:675574/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:690320/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:700414/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:735562/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:780588/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:820277/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:833365/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:865491/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:924513/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:99802/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:276734/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1028909/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1035481/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1045551/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:110402/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1141185/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1147739/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1238098/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1250568/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1383055/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1429533/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1497981/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:153973/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:157711/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1604669/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1663/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:212723/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:239668/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:357488/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCCGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:675503/69‑1 (MQ=255) tAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACAGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:1014212/69‑1 (MQ=255)  aaGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCTTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:131190/68‑1 (MQ=255)     aTCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACg  <  1:614309/65‑1 (MQ=255)                                                                     | TAAGATCAGATTACAACCTGTACGCCAATACTATCACCGTAACTAACGGCGGTGTATTGGATGTGAACG  >  W3110S.gb/392183‑392251

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑