Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4504708	4504717	10	33 [0]	[0] 48	yjgX	ECK4266:JW5764+JW4234+JW5763:b4575; KpLE2 phage‑like element; hypothetical protein

GATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGC  >  W3110S.gb/4504668‑4504707                                        | gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:552873/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:374425/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:462794/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:495080/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:521686/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:523098/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:545337/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:550606/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:55076/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:345525/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:562248/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:608105/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:611651/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:661009/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:764840/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:78015/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:978352/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1011320/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:303771/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:217823/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:203044/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:175286/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:173670/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1423583/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1375857/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1352338/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1281345/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:126190/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1234623/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1199857/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1178569/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1141338/40‑1 (MQ=255) gATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGc  <  1:1133952/40‑1 (MQ=255)                                        | GATGCTGGCGAGGTAACAGGCAATTTTTCGGGGATACTGC  >  W3110S.gb/4504668‑4504707

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑