Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4523498	4523671	174	38 [0]	[0] 45	insB insB	ECK0022:JW4255:b4563; IS1 transposase InsAB', N‑ter fragment ECK0022:JW4255+JW4256:b4576; IS1 transposase InsAB'

CGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACA  >  W3110S.gb/4523430‑4523497                                                                    | cggtGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1167770/65‑1 (MQ=25) cGTTGGCCTCAACTCGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:271613/68‑1 (MQ=25) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCTTACa  <  1:435776/68‑1 (MQ=25) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:572884/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:359284/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:379254/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:406557/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:414840/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:443670/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:503515/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:554056/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:280889/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:574221/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:617861/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:63437/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:749678/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:795232/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:845031/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:869273/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:142045/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1027309/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1067926/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1143457/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1194177/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1332607/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1382700/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1383035/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1394568/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1007417/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1435612/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1441976/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1460275/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:1586234/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:198464/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:26213/68‑1 (MQ=35) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGAATACa  <  1:1560355/68‑1 (MQ=25) cGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACGTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:286343/68‑1 (MQ=25)  gTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACa  <  1:598716/67‑1 (MQ=35)                                                                    | CGTTGGCCTCAACACGGTTTTACGTCACTTAAAAAACTCAGGCCGCAGTCGGTAACCTCGCGCATACA  >  W3110S.gb/4523430‑4523497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑