Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4561203	4561264	62	33 [0]	[0] 119	yjiC/yjiD	hypothetical protein/DNA replication/recombination/repair protein

AGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCA  >  W3110S.gb/4561135‑4561202                                                                    | aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAACCGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1188105/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAGTTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:818786/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:199603/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:98676/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:880604/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:866122/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:852470/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:832824/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:64436/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:612942/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:412113/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:396729/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:282566/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:280220/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:275257/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1016368/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1426280/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1123045/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1236726/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1241340/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1241825/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1338264/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1366316/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:16811/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1445602/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1471142/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1480595/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1530293/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1554290/68‑1 (MQ=255) aGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:1598865/68‑1 (MQ=255)  gggTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:338957/67‑1 (MQ=255)        gAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:971369/61‑1 (MQ=255)                       aTCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCa  <  1:861826/46‑1 (MQ=255)                                                                    | AGGGTAGGAAACACTCTAAAGTATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCA  >  W3110S.gb/4561135‑4561202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑