Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4567743	4567825	83	46 [0]	[0] 188	yjiK	conserved hypothetical protein

ATCTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGCCC  >  W3110S.gb/4567674‑4567742                                                                     | atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTTATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1363073/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:693666/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:490135/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:497562/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:507870/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:533544/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:558738/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:582204/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:609390/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:675049/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:692916/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:456085/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:709125/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:790823/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:791491/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:857378/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:858664/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:92590/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:934221/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:963430/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:96542/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:985926/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1348552/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1059561/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1062581/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1173508/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:119807/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:12010/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1245118/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1277685/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1278610/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1307339/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1322040/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:380297/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1353861/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1572723/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1581391/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:180153/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:220308/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:256429/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:288462/69‑1 (MQ=255) atcTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:293575/69‑1 (MQ=255)   cTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:635209/67‑1 (MQ=255)   cTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1039734/67‑1 (MQ=255)     aaaGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:1461140/65‑1 (MQ=255)                                tCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGccc  <  1:900840/38‑1 (MQ=255)                                                                     | ATCTAAAGTAAATTGCCGTTGTAGTGCCTCGTCTTTGCTGATGTGTAATTCATTGCTACTTAACAGCCC  >  W3110S.gb/4567674‑4567742

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑