Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4640777	4641596	820	77 [0]	[0] 160	[creB]–[creC]	[creB],[creC]

TAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCG  >  W3110S.gb/4640711‑4640776                                                                  | tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATTGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1597239/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:425903/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:526918/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:485403/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:484829/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:479386/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:465315/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:464004/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:444494/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:43766/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:546312/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:399907/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:389063/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:339414/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:304513/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:299593/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1004166/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:253033/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:756557/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:998491/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:974085/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:923981/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:892077/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:874835/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:871309/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:868190/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:809891/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:288250/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:749486/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:698303/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:68440/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:653541/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:604191/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:596857/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:575236/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1132138/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1375166/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:222286/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1307415/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1300701/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1298338/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1281292/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:119102/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1166704/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1322968/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1131978/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1114527/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1072173/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1060981/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1052660/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1019670/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1015834/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:101320/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1401273/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:209441/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:160890/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1588617/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1553673/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1504824/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1498799/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1494791/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1486458/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1437260/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1434392/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1431559/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1410027/66‑1 (MQ=255) tAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGGTTTGCCg  <  1:770780/66‑1 (MQ=255) tAGGGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:514359/66‑1 (MQ=255)  aGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:85928/65‑1 (MQ=255)  aGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1365153/65‑1 (MQ=255)  aGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:926620/65‑1 (MQ=255)   gTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:807685/64‑1 (MQ=255)         gATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:1591028/58‑1 (MQ=255)           tGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:266272/56‑1 (MQ=255)              gCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:181828/53‑1 (MQ=255)                   ggATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:625681/48‑1 (MQ=255)                        gCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCg  <  1:466022/43‑1 (MQ=255)                                                                  | TAGTGGAAGATGAGCAAGGGATAGCCGACACGCTGGTCTACATGTTGCAGCAGGAAGGTTTTGCCG  >  W3110S.gb/4640711‑4640776

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑