Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	416223	416232	10	41 [0]	[0] 193	sbcD/phoB	exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with PhoR (or CreC)

TCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAG  >  W3110S.gb/416154‑416222                                                                     | tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:706760/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:469526/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:488535/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:50767/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:524597/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:542053/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:564310/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:589571/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:637834/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:644968/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:694728/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:465853/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:763173/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:77105/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:836931/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:855498/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:857115/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:868544/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:98097/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:988272/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:991155/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1507550/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1090494/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1145346/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1181645/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1238471/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1271867/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1293526/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1384809/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1392009/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:141083/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1020203/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1509354/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1555362/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:1571144/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:170493/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:289501/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:32489/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:3346/69‑1 (MQ=255) tCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:441056/69‑1 (MQ=255)                                 cTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAg  <  1:346707/37‑1 (MQ=255)                                                                     | TCTGAGGTGTGAAGGATGCGCATAACGGTTCCCTGGCGAAAAAGCATGGGCGCGATTATACCCAAACAG  >  W3110S.gb/416154‑416222

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑