Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	557557	557924	368	62 [0]	[0] 112	sfmA	predicted fimbrial‑like adhesin protein

GGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTG  >  W3110S.gb/557489‑557556                                                                    | ggTAGTTATGGTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:648447/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATTGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:710978/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAGCTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:57117/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:643797/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1018924/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:350049/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:354149/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:440766/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:511490/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:547669/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:559605/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:604827/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:605705/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:606842/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:607217/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:609883/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:629418/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:301691/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:66478/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:695983/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:706852/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:709223/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:73737/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:774465/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:783602/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:836049/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:887157/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:965393/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:972277/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:98263/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1479910/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1059602/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1059649/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1063672/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1079874/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1091939/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:115416/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1159018/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1208394/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1235958/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1253514/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1254133/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1299136/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1423162/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1470836/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:300288/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1522054/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1547891/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:157927/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1588911/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:1606412/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:162548/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:18218/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:188175/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:226844/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:277632/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:28175/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:289330/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:291520/68‑1 (MQ=255) ggTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAACGCTGCCTg  <  1:1249040/68‑1 (MQ=255)  gttgTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:463112/64‑1 (MQ=255)                   gTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTg  <  1:316068/50‑1 (MQ=255)                                                                    | GGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTG  >  W3110S.gb/557489‑557556

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑