Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 558002 558068 67 85 [0] [0] 19 sfmA/sfmC predicted fimbrial‑like adhesin protein/pilin chaperone, periplasmic

GGGCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATTA  >  W3110S.gb/557933‑558001
                                                                    |
gtgcaagcaaATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:477903/67‑1 (MQ=255)
ggtcaagcaaATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1488648/66‑1 (MQ=255)
gggCAAGCCAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1567987/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:321066/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:506631/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:436196/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:408267/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:405279/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:346668/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:328036/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:321142/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:508185/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:281395/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:24216/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:20810/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:20407/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1585229/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:808765/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:991778/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:989860/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:968093/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:924695/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:912354/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:835204/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:815834/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:813496/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1033509/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:792308/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:693554/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:691638/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:68770/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:678488/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:609821/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:565840/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1169215/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1262152/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1267536/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:129976/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1237153/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1580098/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1320895/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1324796/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1348915/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1402181/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1164829/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1414986/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1163209/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:101217/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1043883/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1576092/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1051238/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1481497/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1081243/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1124970/69‑1 (MQ=255)
gggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1415635/69‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:78515/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:771987/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:890817/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:708611/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:702129/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:120766/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1186437/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:623265/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:850102/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1401643/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1578288/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:198977/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1571838/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:269210/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1475123/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1465190/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1463385/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:365343/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:690546/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1388312/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1339557/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:543064/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:586662/68‑1 (MQ=255)
 ggCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:632657/68‑1 (MQ=255)
  gcaagctaATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:297444/67‑1 (MQ=255)
  gcaagcaaATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:736833/67‑1 (MQ=255)
     agcaaATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:751568/64‑1 (MQ=255)
            gCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:421224/57‑1 (MQ=255)
             cTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:1305272/56‑1 (MQ=255)
               gACGCGACTTTTATTATGAGATATTAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATta  <  1:936915/54‑1 (MQ=255)
                                                                    |
GGGCAAGCAAATGCTGACGCGACTTTTATTATGAGATATGAATAATCAAAACCACGTTGTTTTGAATTA  >  W3110S.gb/557933‑558001

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: