Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 580879 581094 216 168 [0] [0] 42 tfaD DLP12 prophage region; ECK0553:JW5815:b0561; predicted tail fiber assembly protein

Only 100 of 168 total aligned reads displayed.

CGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACAC  >  W3110S.gb/580811‑580878
                                                                   |
cGTGTCTGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:106189/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCATAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:780362/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTTTGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1147840/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:488745/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:688767/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:66329/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:658447/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:65559/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:60521/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:600890/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:590971/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:570129/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:529335/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:513701/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:499651/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:704077/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:482494/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:479134/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:463418/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:442830/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:433291/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:432273/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:422200/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:42048/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1026987/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:370479/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:800706/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:991013/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:96844/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:931155/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:924199/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:898925/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:891836/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:884844/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:849908/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:840333/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:828315/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:807961/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:693384/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:788329/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:772676/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:769054/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:759960/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:747514/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:726452/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:713685/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:711097/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:3975/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:700404/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1286005/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:143270/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1426848/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1390062/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1384557/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1363014/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1352950/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1341298/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1330988/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1312523/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1297951/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1292992/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1467203/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1258792/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1219098/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1196721/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1186109/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1168229/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1155716/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1146870/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1136337/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1102942/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1044591/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1033276/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:222185/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:340599/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:324898/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:306602/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:30300/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:302418/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:28808/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:281444/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:273287/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:242703/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:224707/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1478033/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:193668/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:158476/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1573990/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1561468/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1537762/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1510629/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1503566/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCACAAGCAGCGCAacac  <  1:568743/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGGTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:34588/68‑1 (MQ=255)
cGTGTCCGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:870666/68‑1 (MQ=255)
 gtgtCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:81772/67‑1 (MQ=255)
 gtgtCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1553359/67‑1 (MQ=255)
                  aTGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:507401/50‑1 (MQ=255)
                      tgctgGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:463737/46‑1 (MQ=255)
                              gtTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAacac  <  1:1595484/38‑1 (MQ=255)
                                                                   |
CGTGTCGGTTATTCCAAAATGCTGCTGGGTGTTTATGCCTACTTTATAGAGCATAAGCAGCGCAACAC  >  W3110S.gb/580811‑580878

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑