Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 583156 583542 387 124 [0] [0] 215 appY DNA‑binding transcriptional activator

Only 100 of 124 total aligned reads displayed.

TTATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAAGAG  >  W3110S.gb/583088‑583155
                                                                   |
ttATCGACGTGAATAATTAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:758435/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCATATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:140213/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:606624/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:65295/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:562927/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:551136/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:539066/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:494122/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:493184/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:477329/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:457669/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:445825/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:44545/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:396090/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:396004/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:389001/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:345709/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:295321/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:283785/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1000288/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:22840/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:218328/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:171155/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:167567/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:793126/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:947895/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:916335/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:895774/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:876014/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:875469/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:837688/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:835845/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:828002/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:815181/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:794069/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:271360/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:792300/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:780910/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:755445/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:747180/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:745211/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:692911/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:692555/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:685235/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:660664/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:655085/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1135981/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:134801/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1319231/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1300938/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1293985/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1283938/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1253047/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1250987/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1229879/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:121345/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1196758/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1581481/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1132064/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1126880/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1122754/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1102389/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1049608/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1047783/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1040182/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:100963/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1004645/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1004421/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:140011/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1407318/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:143794/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1446994/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1464331/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1468648/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1499738/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1548889/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1394097/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:138927/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1579244/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1387807/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1367444/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1349930/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1366744/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCGGAagag  <  1:1161823/68‑1 (MQ=255)
ttATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTCACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:712345/68‑1 (MQ=255)
 tATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1590668/67‑1 (MQ=255)
 tATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:413569/67‑1 (MQ=255)
 tATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:690712/67‑1 (MQ=255)
 tATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:576423/67‑1 (MQ=255)
  aTCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:876349/66‑1 (MQ=255)
     gACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:425074/63‑1 (MQ=255)
      aCGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1009816/62‑1 (MQ=255)
        gTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1293919/60‑1 (MQ=255)
           aataatGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1246409/57‑1 (MQ=255)
                   gCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:115141/49‑1 (MQ=255)
                    cTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:1412726/48‑1 (MQ=255)
                     tGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:352462/47‑1 (MQ=255)
                         tGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:944629/43‑1 (MQ=255)
                            cAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGTagag  <  1:929090/40‑1 (MQ=255)
                            cAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAagag  <  1:409081/40‑1 (MQ=255)
                                                                   |
TTATCGACGTGAATAATGAGCTGCCTGGCAAATTTACTCTTGATAAGAATGGCTATATTGCTGAAGAG  >  W3110S.gb/583088‑583155

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑