Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	652475	652894	420	61 [0]	[0] 57	citA	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with citB

GAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGTT  >  W3110S.gb/652427‑652474                                                | gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:657996/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1008924/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:290522/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:327923/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:335583/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:433001/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:434794/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:467371/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:491229/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:49742/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:50376/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:5587/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:572538/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:573303/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:640178/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:277895/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:673948/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:67727/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:68011/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:707841/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:741666/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:775181/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:805174/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:859977/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:871468/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:924175/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:929945/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:930782/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:933460/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:979848/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:203601/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1055956/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1066224/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1088558/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1102166/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1132347/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1194119/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1230464/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1326774/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1350250/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1366251/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1422543/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1425542/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1436821/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1468868/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1471813/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1500702/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1537163/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1575853/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1580314/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1580709/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1594903/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:163221/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:168350/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:194291/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:196074/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:203089/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:223108/48‑1 (MQ=255) gAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGAAGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:1482346/48‑1 (MQ=255) gAAACTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:559647/48‑1 (MQ=255)  aaaTTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGtt  <  1:534631/47‑1 (MQ=255)                                                | GAAATTTCCACCCTCAATGCGCAACTGACGCAAATAAAACAATACGTT  >  W3110S.gb/652427‑652474

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑