Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	6705	7326	622	73 [0]	[0] 20	yaaJ	predicted transporter

CACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCA  >  W3110S.gb/6642‑6704                                                               | cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:482535/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:71657/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:715244/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:637945/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:609434/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:602135/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:586880/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:536072/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:511617/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:721049/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:438161/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:436627/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:411006/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:400433/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:384753/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:365054/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:253782/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:211227/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:902006/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:992142/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:979400/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:979016/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:955239/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:954042/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:946675/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:937749/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:911479/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:195252/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:871314/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:828004/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:800779/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:795956/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:792665/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:731097/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:727073/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:725862/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1205077/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:129729/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1288712/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1276846/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1262786/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1262613/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1234417/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1223506/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1206972/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1321792/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1182828/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1172156/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1157803/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1151066/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1147318/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1145329/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1107538/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1041241/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1493243/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:189727/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:180777/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1574744/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1544666/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1542434/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1530744/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1501575/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1501472/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1001445/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1488277/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:148182/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1468280/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1452559/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1437423/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1418330/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:1359057/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:132468/1‑63 (MQ=255) cACTGGCAAAGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCa  >  1:924349/1‑63 (MQ=255)                                                               | CACTGGCAATGGTATGAACCACAGGCGAGAGCAGTAAAATGGCGGTCAAATTGGTAATAGCCA  >  W3110S.gb/6642‑6704

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑