Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	994782	995610	829	80 [0]	[0] 54	[ssuC]–[ssuD]	[ssuC],[ssuD]

ATTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTACGC  >  W3110S.gb/994713‑994781                                                                     | aTTGAGGGCAGGGCACGAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1387980/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGTATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:194302/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:486952/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:691935/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:677863/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:66608/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:653163/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:643286/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:615383/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:594275/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:534456/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:522146/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:720452/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:463609/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:45924/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:448211/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:421892/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:404567/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:398691/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:373199/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:366814/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:861519/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:961447/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:944666/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:938393/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:932077/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:925422/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:92127/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:91467/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:875771/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:873435/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:351165/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:856408/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:844591/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:840196/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:81172/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:789642/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:7853/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:782680/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:743804/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:725708/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1184843/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1274118/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1249053/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1241289/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1222550/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:122011/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1217423/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1215544/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1206543/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1202690/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1324408/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1145081/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1143652/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1137620/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1101756/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1066671/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1022394/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:101428/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1003726/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1532809/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:347754/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:326300/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:316804/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:263697/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:218113/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1602590/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1574506/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1567522/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1001328/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1498269/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1493637/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1422789/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1421695/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1406617/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:138519/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1355382/69‑1 (MQ=255) aTTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:1342476/69‑1 (MQ=255)  ttGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:231666/68‑1 (MQ=255)                                ggATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTAcgc  <  1:749282/38‑1 (MQ=255)                                                                     | ATTGAGGGCAGGGCACCAGGCAGGATCACATGGATAAACAGCGGTATGCCGGATAATCCATAGCTACGC  >  W3110S.gb/994713‑994781

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑