Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1001543 1001684 142 179 [0] [0] 130 ycbS predicted outer membrane usher protein

Only 100 of 179 total aligned reads displayed.

ATCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTG  >  W3110S.gb/1001474‑1001542
                                                                    |
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAAGGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1088622/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACTGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:473270/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTCACCTg  <  1:723620/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:446706/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:617390/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:606453/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:598928/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:573027/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:566464/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:557506/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:520944/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:506769/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:490456/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:459600/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:637947/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:443556/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:436171/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:430708/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:424315/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:399324/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:393824/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:387608/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:348353/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:344564/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:340280/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1000011/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:753986/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:978524/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:960615/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:907386/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:891912/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:885176/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:879166/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:845743/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:811350/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:804141/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:788938/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:782083/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:632343/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:748831/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:748351/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:71952/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:707678/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:687392/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:67165/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:650060/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:645842/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:643063/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:317987/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1238978/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1478343/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1461399/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1439/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1075115/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1087781/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:136873/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1274796/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1256433/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1108864/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1031579/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1211897/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1196817/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1194168/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1180083/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1175339/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1146205/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1139549/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1131535/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1124606/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1593849/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:292569/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:270837/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:262637/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:225580/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:20540/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:199188/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:300907/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:184406/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:165076/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1594313/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1491077/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:159027/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1583048/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1559340/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:154225/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1541345/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1534227/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1523999/69‑1 (MQ=255)
aTCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCAATGACGGTAACCTg  <  1:1377255/69‑1 (MQ=255)
 tCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGTGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1253133/68‑1 (MQ=255)
 tCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1242139/68‑1 (MQ=255)
 tCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:520738/68‑1 (MQ=255)
 tCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:815681/68‑1 (MQ=255)
       aCGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1020209/62‑1 (MQ=255)
         gAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:197307/60‑1 (MQ=255)
              gCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1382075/55‑1 (MQ=255)
               cacaCTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:1474682/54‑1 (MQ=255)
                    tACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:105986/49‑1 (MQ=255)
                     acacAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:140713/48‑1 (MQ=255)
                                 ggTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTg  <  1:705111/36‑1 (MQ=255)
                                                                    |
ATCGATAACGAAGGGCACACTACACAAAACCTGGGTTTAACGGAGACATTACTCGATGACGGTAACCTG  >  W3110S.gb/1001474‑1001542

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑