Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1003431	1003502	72	20 [0]	[0] 215	ycbU	predicted fimbrial‑like adhesin protein

CATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAG  >  W3110S.gb/1003364‑1003430                                                                   | cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTGGATCAg  <  1:2566/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:912588/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1171434/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1173182/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1392124/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1488929/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1556959/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1584814/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:880950/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:222123/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:797621/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:471635/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:525796/67‑1 (MQ=255) cATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:720413/67‑1 (MQ=255)  aTCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:918918/66‑1 (MQ=255)  aTCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:785147/66‑1 (MQ=255)  aTCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:451575/66‑1 (MQ=255)  aTCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1592590/66‑1 (MQ=255)  aTCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1132263/66‑1 (MQ=255)   tCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAg  <  1:1021008/65‑1 (MQ=255)                                                                   | CATCCATGTCGGGATGGCTGGGCCTGAACAAGTTAGTATGCATATTTATGGGAATGTGGTCGATCAG  >  W3110S.gb/1003364‑1003430

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑