Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1012000	1012913	914	75 [0]	[0] 44	[uup]–[pqiA]	[uup],[pqiA]

ATTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAG  >  W3110S.gb/1011931‑1011999                                                                     | aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGTCGCTCAAACAg  <  1:1010448/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAATCAg  <  1:1218061/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAGCAg  <  1:1394493/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:276457/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:48120/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:503805/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:214391/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:211643/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:17822/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:176192/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:547047/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1592216/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:480672/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:689064/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:730593/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1449247/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1427913/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:391425/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1268585/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:104750/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:108844/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1100102/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:917441/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1153482/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:121113/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1211413/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1250862/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:892172/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGGCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:456041/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGGCAGCAAGAGCAGTATGTGCCGCTCAAACAg  <  1:894769/69‑1 (MQ=255) aTTGGTCG‑TATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:467553/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:990790/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:632563/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:476605/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1007752/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:924952/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:881729/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:827051/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:5312/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:901839/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:70280/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:656279/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:559220/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:584617/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:593544/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1510665/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1030084/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:110871/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1118499/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1252317/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1344748/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1471265/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1486417/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:150122/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1506408/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:379340/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1513897/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:197146/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:346820/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:300890/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:275190/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:245235/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:152245/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:166731/68‑1 (MQ=255)  ttGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGGCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:813235/68‑1 (MQ=255)  ttGGGCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1556860/68‑1 (MQ=255)  ttGGGCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:967400/68‑1 (MQ=255)   tGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:755618/67‑1 (MQ=255)   tGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:489395/67‑1 (MQ=255)          tATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:730243/60‑1 (MQ=255)           aTGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:295153/59‑1 (MQ=255)                 gcggTTATCATGATGCCCGTGGGCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1552148/53‑1 (MQ=255)                  cggTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:635102/52‑1 (MQ=255)                    gTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:10674/50‑1 (MQ=255)                      tATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg  <  1:1561370/48‑1 (MQ=255)                                                                     | ATTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAG  >  W3110S.gb/1011931‑1011999

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑