Missing coverage evidence...
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GCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTA  >  W3110S.gb/1157108‑1157175                                                                    | gcgctATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAACCGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1204008/65‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATTTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:16577/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTCCCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGGGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:359791/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:106243/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:994019/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:923064/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:883439/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:864230/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:848614/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:847309/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:770426/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:768313/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:684100/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:389582/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:366532/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:269220/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1593890/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:106883/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1070633/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1077485/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1184743/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1191285/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1011346/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1256587/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1316962/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1340838/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1416799/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1580135/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGGGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:541374/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGGGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:375609/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGGGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:1132046/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGCGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:108957/68‑1 (MQ=255) gCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTGGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:995494/68‑1 (MQ=255)                 aCCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:555540/52‑1 (MQ=255)                 aCCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGGGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:196487/52‑1 (MQ=255)                             ggCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:763830/40‑1 (MQ=255)                              gCTTAAAACGCCCGCGGGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:953840/39‑1 (MQ=37)                                ttAAAACGCGCGCGGGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTa  <  1:67425/37‑1 (MQ=255)                                                                    | GCTCTATCTCGATGTTACCCCGGAAGTTGGCTTAAAACGCGCGCGTGCGCGCGGCGAGCTGGATCGTA  >  W3110S.gb/1157108‑1157175

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑