Missing coverage evidence...
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CAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCC  >  W3110S.gb/1158128‑1158194                                                                   | cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCTcc  <  1:1272738/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:499322/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1540521/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:154454/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1567704/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:234538/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:262034/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:267808/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:332557/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:335889/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:348514/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:391281/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1477982/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:556311/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:567899/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:589988/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:614959/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:622663/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:640908/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:705193/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:780347/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:859547/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:906584/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:949455/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1008341/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:103392/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1036414/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1044785/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1045012/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1057993/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1105526/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1130034/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1174921/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1176768/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:119006/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1208899/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1215406/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1298852/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1323864/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1339832/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1399416/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1418236/67‑1 (MQ=255) cAGGTGACCAATGTTGAGGTGCCGGGCCTGGGCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:909918/67‑1 (MQ=255)  aGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCTcc  <  1:1059592/66‑1 (MQ=255)                      ccGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1137499/46‑1 (MQ=255)                          gCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1455416/42‑1 (MQ=255)                             tGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc  <  1:1008369/39‑1 (MQ=255)                                                                   | CAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCC  >  W3110S.gb/1158128‑1158194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑