Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1173781	1174842	1062	86 [0]	[0] 152	mfd	transcription‑repair coupling factor

ATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTC  >  W3110S.gb/1173712‑1173780                                                                     | aTTAATGGCCTGTGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1514741/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCTGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:142138/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTTGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:689111/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATCCTGCTc  <  1:206231/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTtctc  <  1:1358787/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:451347/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:626416/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:595811/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:551771/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:534952/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:525771/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:523857/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:520640/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:483902/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:650160/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:430214/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:399102/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:383932/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:336454/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:316625/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:30544/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:293563/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1000143/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:796737/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:982130/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:952253/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:929212/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:902094/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:87804/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:848175/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:834668/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:811465/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:810567/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:635492/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:7825/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:77272/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:720738/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:715543/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:683223/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:662304/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:658146/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:657293/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:261345/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1182997/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1385255/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:254768/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1355486/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1327232/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1318238/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1287134/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:126620/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1231776/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1218848/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1382175/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1144853/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1088801/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1080079/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1070396/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1060646/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1057922/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1055933/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1026329/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1021533/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1534688/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:238643/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:184195/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1598750/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1597790/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1387957/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1518699/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1506406/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1502565/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1486717/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1469034/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1468212/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1458220/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1407231/69‑1 (MQ=255) aTTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:140292/69‑1 (MQ=255)  ttAATGTCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1129813/68‑1 (MQ=255)  ttAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:378354/68‑1 (MQ=255)  ttAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:311969/68‑1 (MQ=255)  ttAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:1356212/68‑1 (MQ=255)  ttAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:297342/68‑1 (MQ=255)  ttAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:959198/68‑1 (MQ=255)      tGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:166944/64‑1 (MQ=255)             cgcCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTc  <  1:962695/57‑1 (MQ=255)                                                                     | ATTAATGGCCTGCGCCTGATCCGGCGTGGTTTCAAACGGGAAGCTGTCGCAGAACAACTGATACTGCTC  >  W3110S.gb/1173712‑1173780

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑