Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1223781	1224113	333	64 [0]	[0] 86	[ycgH]–[ymgD]	[ycgH],[ycgH],[ymgD]

CGTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGC  >  W3110S.gb/1223712‑1223780                                                                     | cGTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1296056/69‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGTGTGATAATGGc  <  1:857693/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:275636/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:332957/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:348875/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:369554/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:373632/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:444998/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:484987/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:494880/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:520906/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:523183/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:566099/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:582199/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:586092/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:610468/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:681302/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:689705/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:696534/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:710132/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:726370/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:766271/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:781462/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:830775/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:880419/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:914317/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:932495/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:965587/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:989552/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:99882/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1285096/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1054146/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1061284/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:10749/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1091197/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1094853/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1103228/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1106951/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1118205/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1155650/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1223642/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1232103/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:12634/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1274805/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:270455/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1313626/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1530991/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:267893/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:263223/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:249276/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:181022/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:173555/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1598379/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1376330/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1519356/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1502193/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1477785/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1467065/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1429503/68‑1 (MQ=255)  gTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGGGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:773024/68‑1 (MQ=255)   tAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:557092/67‑1 (MQ=255)                  aTCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:777263/52‑1 (MQ=255)                         ggCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:1009807/45‑1 (MQ=255)                              gCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGc  <  1:946246/40‑1 (MQ=255)                                                                     | CGTAAATGGCAACCTGAATCCAGCGGCCAGCGTCTGGGGAATGTGGGCGTGCAGCTGGGTGATAATGGC  >  W3110S.gb/1223712‑1223780

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑