Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1242961	1243015	55	48 [0]	[0] 32	cvrA	predicted cation/proton antiporter

ACACCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGC  >  W3110S.gb/1242901‑1242960                                                            | acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:682380/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1076/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:442090/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:470062/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:48744/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:519358/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:523323/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:538341/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:53927/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:539804/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:606489/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:658070/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:420522/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:713818/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:778701/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:786274/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:808441/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:8126/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:871245/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:923982/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:927363/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:948650/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:977563/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:98453/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1406977/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1129747/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:11419/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1166919/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1182138/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:119508/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1205190/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1291653/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1316074/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1321322/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1326749/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1084865/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1429098/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1451330/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1452911/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1477856/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1511799/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1532890/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:202478/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:214699/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:388239/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:398984/60‑1 (MQ=255) acacCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAG‑AAATCAGAATACCGc  <  1:433516/59‑1 (MQ=255)               ccGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGc  <  1:1368270/46‑1 (MQ=255)                                                            | ACACCGCCAGAATACCGCTACCTTCCAGCGCAGTAGTTAATGAGAAAATCAGAATACCGC  >  W3110S.gb/1242901‑1242960

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑