Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1244348	1244938	591	65 [0]	[0] 101	[ldcA]–[emtA]	[ldcA],[emtA]

GCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTC  >  W3110S.gb/1244280‑1244347                                                                    | gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCTATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:318065/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:510539/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:633678/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:629902/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:617549/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:570438/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:558911/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:557264/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:55699/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:530584/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:642510/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:500308/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:497005/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:493265/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:475510/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:456770/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:414445/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:364110/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:707914/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:755113/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:759319/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:766829/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:822452/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:822763/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:853307/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:868102/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:872110/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:934398/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:940934/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:948065/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:956547/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:973422/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:979772/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1388824/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1048785/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1082028/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1109425/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1131132/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:115045/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1173887/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1178742/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1218769/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:124605/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1260278/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1260849/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1285370/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1316413/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1355693/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1369851/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:400742/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:140790/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1442522/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1447411/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:146039/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1511340/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1524109/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1591476/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1598963/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:177375/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:282413/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:285596/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:313074/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:317095/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:35262/1‑68 (MQ=255) gCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGTACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTc  >  1:1027888/1‑68 (MQ=255)                                                                    | GCCGCTAAAGGTGATGACATTGCCATGCGCCAGAAGACCGCACTGAATGGCGGTAAAATCGCTATGTC  >  W3110S.gb/1244280‑1244347

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑