Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	55007	56544	1538	51 [0]	[0] 92	imp	exported protein required for envelope biosynthesis and integrity

GCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGC  >  W3110S.gb/54938‑55006                                                                     | gcagGAGCTGTATTGCCCACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:540234/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGGGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:3073/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:499301/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:189124/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:211902/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:866906/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:235454/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:274953/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:319352/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:427593/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:470744/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:477825/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1607314/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:520336/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:859073/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:850407/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:807530/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:752220/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:738782/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:601569/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:695410/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1338354/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1007004/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1048981/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1075107/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1096986/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1100583/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1161241/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1308706/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1316371/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1319202/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1352696/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:13582/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1387076/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1393508/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1436920/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:979972/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:87413/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1577884/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1605215/69‑1 (MQ=255) gcagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGGCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:985019/69‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:591522/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:572061/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:552180/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:530655/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:520419/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:229617/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1574078/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:87851/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1450780/68‑1 (MQ=255)  cagGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc  <  1:1022212/68‑1 (MQ=255)                                                                     | GCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGC  >  W3110S.gb/54938‑55006

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑