Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	59285	59420	136	77 [0]	[0] 20	yabQ/rluA	hypothetical protein/pseudouridine synthase for 23S rRNA (position 746) and tRNAphe(position 32)

TGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAA  >  W3110S.gb/59216‑59284                                                                     | tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:360721/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:425538/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:422377/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:413161/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:408074/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:405971/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:394086/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:391061/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:391035/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:364113/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:431286/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:359336/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:352284/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:317881/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:3077/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:304310/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:27760/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:273771/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:254404/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:587408/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:984487/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:983308/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:982983/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:93860/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:886817/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:867442/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:803918/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:721364/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:676342/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:244119/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:57622/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:559207/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:553235/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:504223/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:482987/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:473741/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:449862/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:447901/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1129819/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1018285/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1251113/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1247730/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1217556/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1216326/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1177366/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1160594/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1137536/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1136875/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:125869/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1110526/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1074757/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1060563/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1054829/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1052929/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1041143/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1032178/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1027201/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1478517/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:213887/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:210047/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:196103/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:169689/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1605948/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:160317/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1534322/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:15311/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1317779/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1472937/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1459250/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1456697/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1416131/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1403281/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1385125/69‑1 (MQ=255) tGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1333712/69‑1 (MQ=255)  gCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:548965/68‑1 (MQ=255)          aaaaGTAGTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1323012/60‑1 (MQ=255)                           aaTTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTaa  <  1:1029381/43‑1 (MQ=255)                                                                     | TGCTACTAAAAAAGTACTGCTGAACAAATTACTGACAACGCAATTATTGAATGAGCCAGAATAAGCTAA  >  W3110S.gb/59216‑59284

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑