Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1337229	1337293	65	64 [0]	[0] 34	yciX/acnA	ECK1270:JW5198+JW5199:b4574; hypothetical protein/aconitate hydratase 1

TCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCGC  >  W3110S.gb/1337183‑1337228                                              | tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:756530/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:370122/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:376990/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:407668/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:458935/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:511306/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:628730/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:632672/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:676988/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:690441/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:705487/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:712872/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:714638/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:714820/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:745170/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:751313/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:359625/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:76010/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:786952/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:792346/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:824577/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:83620/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:838639/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:84263/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:878972/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:886669/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:900050/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:905743/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:943470/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:990103/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:995690/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:996143/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1390526/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1026609/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1041153/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1043048/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1051147/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1057214/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1082635/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1110343/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1122080/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1127768/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1152160/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1153261/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1197636/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1253021/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1327521/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1366401/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1023708/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1412517/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1458547/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:147531/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1481168/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1483011/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1512206/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1512569/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1525385/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1558416/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:1563980/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:231507/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:242227/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:243455/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:266828/1‑46 (MQ=255) tCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCgc  >  1:333993/1‑46 (MQ=255)                                              | TCTTATTACCCATTTTTAATGAATTAAAGGGCTTTTAATACACCGC  >  W3110S.gb/1337183‑1337228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑