Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1384428 1385425 998 78 [0] [0] 89 [ompG]–[ycjW] [ompG],[ycjW]

TTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCG  >  W3110S.gb/1384358‑1384427
                                                                     |
ttGGGCTGGATCGCTGGAGTACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:512306/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGTATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1095101/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:479842/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:556949/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:555230/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:554943/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:554322/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:546276/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:507811/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:497783/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:481125/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:611582/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:459049/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:441152/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:410280/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:346590/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1039841/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:283938/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:253918/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:692286/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:994093/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:978779/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:941447/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:911713/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:887224/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:871247/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:856942/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:786415/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:608894/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:692046/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:677493/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:6645/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:664147/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:663680/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:644262/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:618912/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:331085/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1373748/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1070687/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1089936/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1137168/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1155641/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1173384/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:118625/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1203944/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1275137/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1285590/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1307065/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1309355/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1335036/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1358528/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1377181/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:139526/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:167629/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:247490/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:212961/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:190393/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:189532/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1464596/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1584621/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1534106/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:156969/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1542813/69‑1 (MQ=255)
 tGGGCTGGATCGCCGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:826733/69‑1 (MQ=255)
  gggCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:729029/68‑1 (MQ=255)
  gggCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:252832/68‑1 (MQ=255)
  gggCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:387266/68‑1 (MQ=255)
  gggCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1104863/68‑1 (MQ=255)
  gggCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1099689/68‑1 (MQ=255)
   ggCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1285136/67‑1 (MQ=255)
   ggCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:217011/67‑1 (MQ=255)
         aTCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1584680/61‑1 (MQ=255)
           cGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:950587/59‑1 (MQ=255)
              tGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATTATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:576396/56‑1 (MQ=255)
                          gACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:498996/44‑1 (MQ=255)
                             tGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:17056/41‑1 (MQ=255)
                             tGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1314935/41‑1 (MQ=255)
                                cAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCg  <  1:1375647/38‑1 (MQ=255)
                                                                     |
TTGGGCTGGATCGCTGGAGTAACTGGGACTGGCAGGATGATATTGAACGTGAAGGCCATGATTTTAACCG  >  W3110S.gb/1384358‑1384427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: