Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1415835	1416475	641	54 [0]	[1] 103	recT	recombination and repair protein

TTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACA  >  W3110S.gb/1415779‑1415834                                                        | ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:708772/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:356553/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:376079/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:399937/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:438220/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:454734/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:460607/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:463832/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:560592/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:574109/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:59068/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:623865/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:669379/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:681377/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:349527/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:713558/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:749246/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:74981/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:767475/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:799550/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:801587/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:820938/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:856353/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:870053/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:872241/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:920022/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:92862/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1484144/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1067766/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1082733/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1164271/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1275528/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:127921/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:128037/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1308915/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1326727/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1334840/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1359146/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1383421/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1390755/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1448654/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1044643/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1491498/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1543558/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1562034/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1568243/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:1577827/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:181164/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:196965/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:244554/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:262331/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:27353/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:278350/1‑56 (MQ=255) ttCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACa  >  1:322969/1‑56 (MQ=255)                                                        | TTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGAACA  >  W3110S.gb/1415779‑1415834

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑