Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1427958	1428160	203	47 [0]	[0] 31	ydaY/ynaA	hypothetical protein/predicted tail protein

ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTG  >  W3110S.gb/1427892‑1427957                                                                  | aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:600863/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1032192/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:197763/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:239717/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:302119/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:424357/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:434336/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:464042/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:491269/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:504732/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:524731/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:193835/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:695143/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:701370/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:7074/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:764685/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:801569/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:808806/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:826570/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:86530/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:90703/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:966393/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1596352/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1052895/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:106915/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1174461/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1178239/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1195721/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1228958/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1229267/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1249843/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1260492/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1288973/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1306469/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1391311/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1421636/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1432530/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1436535/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1532138/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1540533/66‑1 (MQ=255) aCAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1557771/66‑1 (MQ=255)  cAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1569561/65‑1 (MQ=255)      gaTAAATGAATATTTAGCCACTCATCCTGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:1564066/61‑1 (MQ=255)             gAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:167674/54‑1 (MQ=255)              aaTATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:587579/53‑1 (MQ=255)              aaTATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:303980/53‑1 (MQ=255)                        cACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTg  <  1:540083/43‑1 (MQ=255)                                                                  | ACAGAGATAAATGAATATTTAGCCACTCATCCGGTATTGATTGAGCGCGATGAATTTGAAGCAGTG  >  W3110S.gb/1427892‑1427957

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑