Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 1472870 | 1473189 | 320 | 138 [1] | [0] 28 | ydbA ydbA |
ECK1398:JW5802+JW1402:b4492; predicted outer membrane protein ECK1398:JW1402:b1405; predicted outer membrane protein, C‑ter fragment |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTAAT > W3110S.gb/1472802‑1472871 | tataGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1052567/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAAATGGTa > 1:880618/1‑69 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:438063/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:64541/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:644/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:621217/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:605493/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:56167/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:553956/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:535534/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:524850/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:505502/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:493039/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:4796/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:452941/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:657626/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:416130/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:399042/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:391457/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:375328/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:354529/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:346805/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:311302/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:309719/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:309010/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:300938/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:794138/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:957771/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:930783/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:904887/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:902462/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:897653/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:878873/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:873476/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:867979/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:846125/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:832430/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:82343/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:64831/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:776162/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:771551/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:765681/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:722848/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:715920/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:707124/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:672422/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:665498/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:659435/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1008436/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1224967/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:139588/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1379168/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1358983/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1354374/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1354021/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1336323/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1331929/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1321358/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1298233/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1286203/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1270294/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1263468/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1409264/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:119591/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1194910/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:118357/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1172968/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:115082/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:11250/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1094106/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1085329/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1068954/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:106782/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1067220/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1004052/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1411051/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:252346/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:214514/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:192568/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:187887/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:174408/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:168406/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:161801/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1600132/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1600035/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1587215/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1584352/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:157168/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1546635/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1520783/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1503581/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1492941/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1489916/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1485914/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:1477938/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:146008/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:276121/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑‑AAAAAATGGTAAt > 1:556581/1‑69 (MQ=255) tATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGCGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:296139/1‑68 (MQ=255) tATGGCGGCCTAGGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTa > 1:432590/1‑68 (MQ=255) | TATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCG‑AAAAAAATGGTAAT > W3110S.gb/1472802‑1472871 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |