Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | W3110S.gb | 1474366 | 1474768 | 403 | 143 [0] | [0] 162 | ydbA ydbA |
ECK1398:JW5802+JW1402:b4492; predicted outer membrane protein ECK1398:JW1402:b1405; predicted outer membrane protein, C‑ter fragment |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAG > W3110S.gb/1474297‑1474365 | aTGAACGGTAACAACGGTAATAGGAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:933423/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGTAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:688332/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTTCCGAAg < 1:299/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:47781/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:6391/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:623495/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:584175/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:580185/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:562183/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:536539/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:515004/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:507719/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:491880/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:486884/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:48351/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:663009/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:464193/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:439564/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:402197/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:39352/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:388094/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:383884/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:356906/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:31846/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1018068/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:303480/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:820495/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:952181/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:944554/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:971768/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:914097/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:91163/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:91107/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:884386/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:872681/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:852570/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:826919/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:824028/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:9625/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:781379/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:780600/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:763485/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:759534/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:716346/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:709429/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:699908/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:694281/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:978559/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:664862/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1145699/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:27948/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1309018/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1303510/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1291816/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:12611/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1248041/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1245445/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1214959/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1211885/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1195864/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1173686/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1322377/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1144399/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1135371/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1112005/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1103703/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1090622/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1083127/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1074934/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1045076/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1039490/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1022100/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1021847/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1570728/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:265004/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:254038/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:249163/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:238573/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:227500/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:216842/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:191176/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:186930/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:161740/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1589331/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1580325/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1365681/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1507212/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1474011/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1471513/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1468812/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1461962/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1396924/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1395661/69‑1 (MQ=255) aTGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1390244/69‑1 (MQ=255) tGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:893372/68‑1 (MQ=255) tGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1305323/68‑1 (MQ=255) tGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1374913/68‑1 (MQ=255) cGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:622209/55‑1 (MQ=255) tAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:1257918/49‑1 (MQ=255) aaGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAg < 1:304857/41‑1 (MQ=255) | ATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAG > W3110S.gb/1474297‑1474365 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |