Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 1546926 1547180 255 169 [0] [0] 158 yddK hypothetical protein

Only 100 of 169 total aligned reads displayed.

ATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCTATA  >  W3110S.gb/1546861‑1546925
                                                                |
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:458882/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:643726/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:630681/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:616944/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:614732/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:610259/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:565551/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:554754/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:552858/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:540248/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:510868/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:503636/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:466897/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:646133/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:437802/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:416465/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:411958/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:387591/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:344673/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:343440/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:326803/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:302989/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:299563/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1022961/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:29190/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:850016/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:985137/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:967082/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:95019/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:948807/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:943275/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:923132/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:916600/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:900327/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:866027/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:861822/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:856283/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:297073/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:816743/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:809637/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:798988/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:79723/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:762804/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:752988/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:750300/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:747062/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:718595/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:703108/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:679987/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1195358/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1365310/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1335462/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1321224/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1313868/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1298796/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1296354/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1279566/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1233637/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1233053/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1228197/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1197229/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:215602/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1173411/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1163413/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:116129/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1150100/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1113554/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1109032/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1106871/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1102684/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1096635/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1051740/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1023870/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1506086/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:244079/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:195613/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:168602/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:164501/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1585181/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1580748/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1569794/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1536545/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1525878/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:152110/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1517277/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1382736/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1499001/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1495094/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1473505/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1442846/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1421828/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1416162/62‑1 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  >  1:1396979/1‑62 (MQ=255)
   gCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1396030/62‑1 (MQ=255)
   acacaAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:331692/61‑1 (MQ=255)
    cacaAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1216187/61‑1 (MQ=255)
    cacaAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:822436/61‑1 (MQ=255)
    cacaAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:487524/61‑1 (MQ=255)
    cacaAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:13822/61‑1 (MQ=255)
         aCTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCtata  <  1:1480884/56‑1 (MQ=255)
                                                                |
ATTGCACAAACTCTAGTTGATTATGTGCCGCACTAAAATAAGTAACTGATGAAAGCCTATCTATA  >  W3110S.gb/1546861‑1546925

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑