Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1589522	1589614	93	74 [0]	[0] 122	ydeR	predicted fimbrial‑like adhesin protein

CTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTA  >  W3110S.gb/1589457‑1589521                                                                 | cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:492898/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:634988/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:626622/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:608614/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:594545/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:582382/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:5426/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:530783/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:525531/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:652630/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:488690/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:486833/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:479900/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:468929/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:415054/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:399026/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:348554/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1002295/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:818299/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:980143/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:9686/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:949702/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:941703/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:912947/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:89121/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:882041/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:87789/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:339685/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:789529/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:784261/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:764712/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:762071/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:76180/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:74359/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:670644/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:661076/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1274959/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1439964/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1425439/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1415152/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1412264/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1396749/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1365463/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1325964/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1303347/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1293104/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:148164/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1266784/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1255594/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1146632/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1098703/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1096220/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1033705/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1017544/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:10031/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:15618/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:32219/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:315461/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:272551/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:246586/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:233241/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:227191/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:226352/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:223732/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:324429/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1539437/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1532939/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1521351/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1514248/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1505773/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1487038/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:1486966/1‑65 (MQ=255) cTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATAGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:588134/1‑65 (MQ=255) cTAAAGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTa  >  1:418593/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CTAAGGTTAAAAATTGATTTAAAAAGAAGGCTAAGAAAATCGAATCGACGTTATTGCCAGGTGTA  >  W3110S.gb/1589457‑1589521

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑