Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1852178	1853385	1208	56 [0]	[0] 220	[sppA]–[ansA]	[sppA],[ansA]

GGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGA  >  W3110S.gb/1852111‑1852177                                                                   | tggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:918879/66‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGTTTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:911565/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCTATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1355008/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCGGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:597160/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:555480/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1011651/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:261484/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:283556/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:289094/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:294719/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:342701/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:350277/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:365493/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:366853/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:398919/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:472717/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:52380/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1602848/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:59126/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:653025/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:753201/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:774482/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:828574/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:834045/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:83566/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:855343/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:905695/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:945432/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1308551/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1027360/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1081571/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1134479/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1151580/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:116657/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1169925/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1202788/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1217649/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1287752/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:129955/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1597146/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1309776/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1335908/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1376217/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1388363/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1439418/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:144738/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1532932/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1548085/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:154930/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1570120/67‑1 (MQ=255) gggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1593062/67‑1 (MQ=255) gggCTGGGCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1052488/67‑1 (MQ=255)  ggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:1274447/66‑1 (MQ=255)  ggCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:826874/66‑1 (MQ=255)             aGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:286153/55‑1 (MQ=255)                 tcGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGa  <  1:142021/51‑1 (MQ=255)                                                                   | GGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCAAAAGTGA  >  W3110S.gb/1852111‑1852177

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑