Missing coverage evidence...
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GTGGTGGCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTGG  >  W3110S.gb/1884343‑1884410                                                                    | gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:740903/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1000978/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:555667/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:557876/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:589173/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:596767/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:599600/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:612138/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:64729/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:714929/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:472851/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:766270/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:794914/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:806794/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:808570/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:829853/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:852392/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:958008/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:961959/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:985124/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1409344/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:10010/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1020898/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1188579/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1239402/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1249530/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:126042/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1284494/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1286325/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1339378/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:456672/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1475829/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:1514780/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:216122/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:335928/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:377880/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:380833/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:411765/68‑1 (MQ=255) gtggtggCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:415242/68‑1 (MQ=255)                   tttgGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTgg  <  1:666294/50‑1 (MQ=255)                                                                    | GTGGTGGCGTCCAATTTGTTTGGCGATATCCTTTCCGATCTTGGCCCGGCCTGCACCGGCACCATTGG  >  W3110S.gb/1884343‑1884410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑