Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1904071	1904139	69	13 [0]	[7] 21	manX	fused mannose‑specific PTS enzyme IIAB components

GTCGTCGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATG  >  W3110S.gb/1904002‑1904070                                                                     | gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTTGAAACGTTAATg  <  1:1011541/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:1278243/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:1340835/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:1356354/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:1370278/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:1414472/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:175683/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:602270/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:684744/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:759044/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:759848/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:860588/69‑1 (MQ=255) gtcgtcGACAAAGAGCATTATGAAGGCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATg  <  1:885663/69‑1 (MQ=255)                                                                     | GTCGTCGACAAAGAGCATTATGAAGTCATTGCAGGCGTTAACATTCCAATGCTCGTGGAAACGTTAATG  >  W3110S.gb/1904002‑1904070

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑